卫生部中日友好医院是由日本国政府提供无偿援助，中日两国政府合作建设的大型综合性现代化医院。1984年10月23日开院，直属中华人民共和国卫生部领导。医院位于北京市朝阳区和平里樱花东路，占地9.7公顷，建筑面积近12万平方米，现编制床位1315张，设有58个临床、医技科室，附设中日友好临床医学研究所及培训中心。医院以疑难疾病、危急重症诊治为重点，以中西医结合为特色，融医疗、教学、科研、康复和预防保健等多项功能为一体，同时承担中央干部保健任务以及100多个国家、地区的涉外医疗任务。
    卫生部中日友好医院于1993年被评为国家三级甲等医院,并先后被评为北京市“十佳”医院和全国“百佳”医院。2001年被列为中央保健医院。同时是北京大学临床医学院和北京中医药大学临床医学院。医院拥有一大批国内外知名专家、学者和优秀的中青年医务工作者，现有副高级技术职称以上人员470余人，硕士研究生学历以上人员近600人。拥有螺旋扫描CT机、磁共振成像系统、血管造影X线机、医用直线加速器等性能先进的大型医疗设备。
    卫生部中日友好医院始终坚持“科教兴院”、“人才强院”的发展战略，已逐步形成了自己的特色和优势。建院以来，医院承担多项国家级、省部级科研课题，曾获国家级、省部级科技进步奖等多项奖励，先后培养了500多名博士和硕士研究生。2005年先后成立了“全国中西医结合心血管病中心”和“全国疼痛诊疗研究中心”。医院的肾病中心、神经内科、中西医结合心血管病中心、骨科、中医肿瘤科分别承担卫生部临床学科重点项目；中医肿瘤科是国家中医药管理局重点学科；电化疗科的电化学疗法、肛肠科的“安氏疗法”、口腔科“当代口腔正畸直丝弓矫治技术及徐氏滑动直丝弓矫治技术”分别是国家卫生部十年百项计划项目；骨科、中医风湿病科、电化疗科、检验科承担着首都医学发展科研基金重点项目。
    建院以来，卫生部中日友好医院作为全国医疗行业对外交流的窗口，曾被外国人在京协会评为“外国人在京就医国有医院满意率第一单位”，并与日本、美国、法国、韩国等许多国家的大学、科研单位和医疗机构建立了良好的合作关系。
    北京取得奥运会举办权之后，中日友好医院成为首批北京奥运会定点医院，也是唯一收治运动员的定点医院，承担国家体育馆“鸟巢”的奥运医疗保障任务。 2004年12月起，医院率先实行356天无假日门诊。2006年被认定为北京市A类定点医疗机构，全市医保参保者均可前来就医。
    展望未来，医院将根据“打造一个品牌、实现两个满意、增强三种意识、倡导四种氛围、建立五种体系”的战略发展理念，按照“2006—2010年事业发展规划纲要”，进一步解放思想，开拓创新；加强专科、专病、专业组建设和新技术、新项目、新方法开展，逐渐实现院有重点、科有特色、人有专长；始终坚持“患者至上，文明行医”的办院宗旨和以人为本的服务理念，为把医院建设成国内一流、国际知名，以疑难疾病、危急重症诊治为重点，以中西医结合为特色的大型综合性现代化医院而不懈努力。